باستخدام الرنين المغناطيسي لدراسة البروتين الحركة: مقابلة مع فابيان فريجي، مدرسة المعلمين العليا في باريس

رؤى من صناعة 

فابيان فريجي 

مدرسة المعلمين العليا في باريس 

يمكنك أن تعطينا لمحة موجزة عن العمل الذي قدم في ENC عام 2014 (مؤتمر الرنين المغناطيسي التجريبية النووية)؟ 

قدمت بعض الأعمال عملت باستخدام النموذج الجديد من بروكر. نحن نحاول أن ننظر إلى بعض الخصائص بطريقة مختلفة جدا لأسلوب الرنين المغناطيسي النووي المعتادة من خلال استخدام الحقل المغناطيسي متجانسة ثابتة في المغناطيس المبردة . 

ما نريد القيام به الآن هو استكشاف بعض الخصائص على مجموعة واسعة من المجالات المغناطيسية وأرخص وسيلة بالنسبة لنا لتحقيق ذلك هو مجرد تحرك عينات لدينا بعيدا عن قلب دينا بروكر المجال المغناطيسي عالية بقدر ما نحتاج إليه. 

في حالتنا، وهذا هو مجرد بضع عشرات من السنتيميرات ولهذا نستخدم شيئا نسميه "المكوك"، والذي هو مجرد عينة صغيرة جدا التي ندفع الهواء بأسرع ما يمكن فيها مثل ضربة بندقية . 

نحن سننظر في بعض الخصائص في الحقل المنخفض ويمكننا كشف ومراقبة عالية الدقة  للطيف NMR . 

ما هي بعض الأحداث التي كنت قد تمكنت من إلقاء نظرة على هذا النظام؟ 

الممتلكات ونحن نبحث في غير ما نسميه "الاسترخاء" التي تشير إلى المعدل الذي نظامنا هو العودة إلى التوازن. 

نحن نبحث على هذا المعدل من الاسترخاء مع الحقول المغناطيسية المختلفة بدلا من مجرد مجال مغناطيسي عال، لأن الناس التي كانت تقوم بها لبضعة عقود. لقد درس الناس الاقتراحات البروتين على نانوثانية بيكو ثانية والجداول الزمنية باستخدام حقول عالية فقط، ولكن نحن الآن قادرين على الميدان وتختلف خريطة الأحداث المغناطيسية التي تحدث في مجموعة صعبة من فترات زمنية، على وجه الخصوص، نانو ثانية. 

هذا من الصعب أن ننظر، لأنها فترة زمنية حيث البروتينات فقط تدوير بشكل طبيعي، وهو ما نسميه نشر التناوب. حتى مجرد مع لقطات من جزيئات الماء، البروتينات تتحرك، ولذا فإنه من الصعب جدا لملفوفيات الاقتراحات الجوهرية من البروتين وهذا تراجع بشكل عام. 

لقد طبقت لأول مرة تقنية جديدة لاليوبيكويتين البروتين النموذج الذي تمت دراسته من قبل NMR لمدة 20 إلى 25 عاما، وتميزت بشكل جيد جدا بطرق مختلفة، بما في ذلك هيكلها والاقتراحات. 

ما رأيناه باستخدام هذا الجهاز للنظر في الاسترخاء على طائفة واسعة من المجالات المغناطيسية، هو أكثر من ذلك بكثير الحركة مما كنا نظن في الواقع سنكون قادرين على رؤية. في حالة اليوبيكويتين، على سبيل المثال، هناك في مكان ما المقابل الذي يتحرك على نطاق واسع جدا، وهذه الاقتراحات هي أمور مهمة جدا لأنها تحدث عندما اليوبيكويتين ملزما للبروتين آخر. 

ما هو عظيم أيضا عن الاسترخاء هو أن الآن يمكننا توصيف الجدول الزمني لهذه الاقتراحات، التي لا يمكن الوصول إليها لتقنيات تجريبية أخرى استنادا NMR.